Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UPF2Q9HAU5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UPF2Q9HAU5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms