Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRKRIP1Q9H875 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms