Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRIM15Q9C019 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms