Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRIM55Q9BYV6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRIM55Q9BYV6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms