Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms