Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SNHG12Q9BXW3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms