Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RAB11FIP5Q9BXF6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms