Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
BRIP1Q9BX63 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BRIP1Q9BX63 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms