Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
REPIN1Q9BWE0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms