Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC94Q9BW85 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC94Q9BW85 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms