Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POLR3CQ9BUI4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLR3CQ9BUI4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms