Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CENPOQ9BU64 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CENPOQ9BU64 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms