Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms