Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP8Q99708 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms