Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COPS8Q99627 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms