Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPS6KC1Q96S38 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
RPS6KC1Q96S38 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms