Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX18Q96RF0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms