Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAB3IPQ96QF0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAB3IPQ96QF0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms