Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CELF6Q96J87 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CELF6Q96J87 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms