Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM52Q96A61 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM52Q96A61 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms