Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC47Q96A33 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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