Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSR2Q969E8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms