Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FRAT1Q92837 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FRAT1Q92837 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms