Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHIPQ8WWQ0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PHIPQ8WWQ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms