Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC107Q8WV48 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms