Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
TRIM41Q8WV44 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms