Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C15orf40Q8WUR7 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C15orf40Q8WUR7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms