Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
MCOLN3Q8TDD5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MCOLN3Q8TDD5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms