Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
BEST4Q8NFU0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
BEST4Q8NFU0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms