Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PIK3C3Q8NEB9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms