Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNNM3Q8NE01 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNNM3Q8NE01 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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