Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HJURPQ8NCD3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms