Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM71E2Q8N5Q1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM71E2Q8N5Q1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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FAM71E2Q8N5Q1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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FAM71E2Q8N5Q1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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