Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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