Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HECW1Q76N89 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HECW1Q76N89 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms