Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC80Q76M96 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms