Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDZD4Q76G19 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PDZD4Q76G19 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms