Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms