Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRI6

C15orf39, Uncharacterized protein C15orf39, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf39Q6ZRI6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C15orf39Q6ZRI6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms