Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CASC2Q6XLA1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms