Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATL3Q6DD88 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms