Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
EEF1DP3Q658K8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EEF1DP3Q658K8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms