Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF3Q5VWG9 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms