Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RNF20Q5VTR2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms