Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
WDR44Q5JSH3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
WDR44Q5JSH3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms