Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC178Q5BJE1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms