Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4orf46Q504U0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms