Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDNFQ49AH0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms