Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF212Q495C1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF212Q495C1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF212Q495C1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms