Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ANKRD55Q3KP44 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms